不同于一般农贸市场，农批市场作为农产品流通体系的上流环节，需要拥有能够支撑大规模、快速集散或配送农产品能力的基础设施，这就使得农批市场设计的难度也相应升高。

农产品批发市场功能主要包括水果区、蔬菜区、粮油区、干货区等主要交易区域以及信息中心、物流场、配套酒店、管理办公区等辅助业态。物流场又称冷链仓储中心，是综合冷库、冷链交易中心、分拣中心、仓储区、物流配送区、冷藏停车区等多功能为一体的综合功能区。

由于农批市场的占地面积过大，因此地理位置一般不会位于市中心等地段价格昂贵的区域，同时却要保证拥有便利的交通，以及相对较近的距离，以缩减运输费用。

但传统的农批市场多为简单的交易聚集地，不能承担现代市场对于物流效率、交易管控、食品安全监管、品类细分、冷链保障、储存加工和交易服务的需求。

目前，随着农超对接的逐年放大、农产品供应链竞争日趋激烈、消费升级的日益凸显，使农产品批发市场面临着新兴流通业态的挑战和农产品供应链处于断裂状态的现实。

农批市场设计的优势，在于能够立足于目前市场建设与运营中存在的实际矛盾，通过优化交通动线、业态布局、冷链设施等市场功能，增强市场的贮藏保鲜、吞吐能力，通过前期设计削减后期的运营管理难度，同时灵活运用现代科技，提高农批市场的互联网渗透率以及信息化程度，增加信息采集渠道和传播渠道，使市场能够灵活运用储藏、加工能力和信息开发利用能力，提升市场的服务品质。